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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Pathologie végétale

Zone de texte éditable et éditée et rééditée

TNPhyto - Projet ANR

TNPhyto - Identification par Tn-seq de nouveaux déterminants génétiques de bactéries phytopathogènes, impliqués dans l’infection des plantes et la persistance dans l’environnement
Identification par Tn-seq de nouveaux déterminants génétiques de bactéries phytopathogènes, impliqués dans l’infection des plantes et la persistance dans l’environnement
  • Le projet TNPhyto propose une approche de l’étude des maladies des plantes englobant des facteurs de l’environnement au sens large. L’objectif est d’identifier rapidement par une technique innovante de mutagénèse couplée au séquençage haut débit (Tn-seq), les gènes bactériens nécessaires à la croissance dans les plantes ainsi que ceux impliqués dans la survie dans l’eau de rivière, vecteur de dissémination. Le projet inclut un large panel de souches de bactéries phytopathogènes des groupes, Pseudomonas syringae, Pectobacterium et Dickeya, d’origine épidémique et environnementales. Les résultats nous aideront à prédire la virulence des souches et/ou à développer des stratégies antibactériennes. Plus largement, ce projet ouvrira la voie pour d’autres pathogènes environnementaux en proposant un cadre original à la fois conceptuel et technologique, très prometteur
  • Coordination : UMR 5240 Microbiologie, adaptation et pathogénie (Lyon)
  • Partenaires : INRAE PACA-Avignon (Pathologie végétale); UMR 5240 Microbiologie, adaptation et pathogénie (Lyon); UMR IEES (Paris); Plateforme de bioinformatique, biostatistique et bioanalyse de la métropole lilloise; Swiss Institute of Bioinformatics
  • Responsable pour l'unité : Cindy MORRIS
  • Durée : 2020-2023, 42 mois