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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Pathologie végétale

Zone de texte éditable et éditée et rééditée

Dissémination aérienne

Inoculum aérien de Botrytis cinerea : dissémination à différentes échelles spatiales

L'inoculum aérien de B. cinerea présent au dessus des plantes peut provenir de la sporulation sur les plantes malades (inoculum endogène) mais aussi de spores exogènes de diverses provenances géographiques et de divers types de substrats (dont les 200 espèces hôtes de B. cinerea). La connaissance de l'origine de l'inoculum est importante car l'inoculum exogène, selon son abondance et ses propriétés biologiques, peut affecter directement l'efficacité des méthodes de lutte.

Nos recherches ont porté jusqu'ici sur l'étude des flux de spores à une échelle locale, en particulier entre l'extérieur et l’intérieur d'un abri (tunnel plastique). Mais, il est pratiquement impossible d'observer directement les mouvements à longue distance des microorganismes aéroportés. Aussi, pour aborder cette question, nous avons choisi une approche qui couple la modélisation des trajectoires de masse d'air avec la caractérisation génétique des souches collectées de B. cinerea à partir de l'air sec et des précipitations.

Dissémination aérienne de Botrytis cinerea sur de longues distances

Les résultats indiquent que B. cinerea est toujours présent dans l'air sec. Des corrélations significatives entre l'abondance de l'inoculum et les facteurs climatiques locaux ainsi que les trajectoires des masses d'air ont montré que la source de l'inoculum était non seulement locale mais pouvait être aussi éloignée. Les masses d'air du nord et du sud de l'Europe tendent à apporter un inoculum de B. cinerea plus viable dans la région d'Avignon que celles de de l'Ouest. La diversité génétique des "souches migrantes" est liée à l'origine des masses d'air.

Leyronas, C., Halkett, F., Nicot, P. C. 2015. Relationship between the genetic characteristics of Botrytis sp. airborne inoculum and meteorological parameters, seasons and the origin of air masses. Aerobiologia, 31, 367-380

Diversité génétique de Botrytis cinerea selon l’origine des masses d'air

© Pathologie végétale - INRAE - Avignon

  • Leyronas, C., Halkett, F., Nicot, P. C. 2015. Relationship between the genetic characteristics of Botrytis sp. airborne inoculum and meteorological parameters, seasons and the origin of air masses. Aerobiologia, 31 (3), 367-380.  https://hal.inrae.fr/hal-01268891v1
  • Leyronas, C., Nicot, P. C. 2013. Monitoring viable airborne inoculum of Botrytis cinerea in the South-East of France over 3 years: relation with climatic parameters and the origin of air masses. Aerobiologia, 29 (2), 291-299. https://hal.inrae.fr/hal-02646614v1

Flux d'inoculum de B. cinerea à l'échelle locale

Des flux d'inoculum sont observés entre des tunnels plastique adjacent et entre cultures de différents espèces, ce qui permet de décrire le modèle ci-dessous. A l'intérieur d'un même abri, des mouvements d'inoculum entre le sol, les plantes et l'air sont également observés.

  • mise au point méthodologique combinant un capteur de spores à haut débit et l'utilisation d'un milieu gélosé semi-sélectif pour B. cinerea
  • campagnes de quantification de l'inoculum aérien (concentration, déposition) réalisées à l'intérieur et à l'extérieur de tunnels expérimentaux
  • étude des facteurs physiques et agronomiques influençant les flux d'air dans un abri froid plastique de type tunnel, caractéristique des zones méditerranéennes
  • caractérisation génétique des souches à l'aide de marqueurs microsatellites
  • Fatnassi, H., Leyronas, C., Boulard, T., Bardin, M., and Nicot, P. 2009. Dependence of greenhouse tunnel ventilation on wind direction and crop height. Biosystems Engineering 103, 338-343. https://hal.inrae.fr/hal-02662474v1
  • Leyronas, C., Bardin, M., Duffaud, M., Nicot, P. C. 2015. Compared dynamics of grey mould incidence and genetic characteristics of Botrytis cinerea in neighbouring vegetable greenhouses. Journal of Plant Pathology, 97, 439-447. https://hal.inrae.fr/hal-02641257v1
  • Leyronas, C., Fatnassi, H., Bardin, M., Boulard, T., and Nicot, P.C. 2011. Modelling Botrytis cinerea spore exchanges and production in unheated greenhouses. Journal of Plant Pathology, 93, 407-414 https://hal.inrae.fr/hal-02650232v1
  • Leyronas, C., Nicot, P. 2013. Monitoring viable airborne inoculum of Botrytis cinerea in the South-East of France over 3 years: relation with climatic parameters and the origin of air masses. Aerobiologia, 29, 291-299. https://hal.inrae.fr/hal-02646614v1
Capteur pour les échantillonnages d'air

Capteur pour les échantillonnages d'air

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