En savoir plus

A propos des cookies

Qu’est-ce qu’un « cookie » ?

Un "cookie" est une suite d'informations, généralement de petite taille et identifié par un nom, qui peut être transmis à votre navigateur par un site web sur lequel vous vous connectez. Votre navigateur web le conservera pendant une certaine durée, et le renverra au serveur web chaque fois que vous vous y re-connecterez.

Différents types de cookies sont déposés sur les sites :

  • Cookies strictement nécessaires au bon fonctionnement du site
  • Cookies déposés par des sites tiers pour améliorer l’interactivité du site, pour collecter des statistiques

> En savoir plus sur les cookies et leur fonctionnement

Les différents types de cookies déposés sur ce site

Cookies strictement nécessaires au site pour fonctionner

Ces cookies permettent aux services principaux du site de fonctionner de manière optimale. Vous pouvez techniquement les bloquer en utilisant les paramètres de votre navigateur mais votre expérience sur le site risque d’être dégradée.

Par ailleurs, vous avez la possibilité de vous opposer à l’utilisation des traceurs de mesure d’audience strictement nécessaires au fonctionnement et aux opérations d’administration courante du site web dans la fenêtre de gestion des cookies accessible via le lien situé dans le pied de page du site.

Cookies techniques

Nom du cookie

Finalité

Durée de conservation

Cookies de sessions CAS et PHP

Identifiants de connexion, sécurisation de session

Session

Tarteaucitron

Sauvegarde vos choix en matière de consentement des cookies

12 mois

Cookies de mesure d’audience (AT Internet)

Nom du cookie

Finalité

Durée de conservation

atid

Tracer le parcours du visiteur afin d’établir les statistiques de visites.

13 mois

atuserid

Stocker l'ID anonyme du visiteur qui se lance dès la première visite du site

13 mois

atidvisitor

Recenser les numsites (identifiants unique d'un site) vus par le visiteur et stockage des identifiants du visiteur.

13 mois

À propos de l’outil de mesure d’audience AT Internet :

L’outil de mesure d’audience Analytics d’AT Internet est déployé sur ce site afin d’obtenir des informations sur la navigation des visiteurs et d’en améliorer l’usage.

L‘autorité française de protection des données (CNIL) a accordé une exemption au cookie Web Analytics d’AT Internet. Cet outil est ainsi dispensé du recueil du consentement de l’internaute en ce qui concerne le dépôt des cookies analytics. Cependant vous pouvez refuser le dépôt de ces cookies via le panneau de gestion des cookies.

À savoir :

  • Les données collectées ne sont pas recoupées avec d’autres traitements
  • Le cookie déposé sert uniquement à la production de statistiques anonymes
  • Le cookie ne permet pas de suivre la navigation de l’internaute sur d’autres sites.

Cookies tiers destinés à améliorer l’interactivité du site

Ce site s’appuie sur certains services fournis par des tiers qui permettent :

  • de proposer des contenus interactifs ;
  • d’améliorer la convivialité et de faciliter le partage de contenu sur les réseaux sociaux ;
  • de visionner directement sur notre site des vidéos et présentations animées ;
  • de protéger les entrées des formulaires contre les robots ;
  • de surveiller les performances du site.

Ces tiers collecteront et utiliseront vos données de navigation pour des finalités qui leur sont propres.

Accepter ou refuser les cookies : comment faire ?

Lorsque vous débutez votre navigation sur un site eZpublish, l’apparition du bandeau « cookies » vous permet d’accepter ou de refuser tous les cookies que nous utilisons. Ce bandeau s’affichera tant que vous n’aurez pas effectué de choix même si vous naviguez sur une autre page du site.

Vous pouvez modifier vos choix à tout moment en cliquant sur le lien « Gestion des cookies ».

Vous pouvez gérer ces cookies au niveau de votre navigateur. Voici les procédures à suivre :

Firefox ; Chrome ; Explorer ; Safari ; Opera

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de INRAE par email à cil-dpo@inrae.fr ou par courrier à :

INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Menu Logo Principal Unité de pathologie végétale - Inra Avignon

Pathologie végétale

Zone de texte éditable et éditée et rééditée

MORRIS Cindy

Directrice de recherche, Animatrice de l'équipe MISTRAL

CONTACT/PROFIL

 ACTIVITES DE RECHERCHE

  • Ma recherche porte sur l'écologie bactérienne. Mon équipe cherche à comprendre comment l'adaptation des bactéries à leur environnement affecte deux phénomènes apparemment contradictoires sur l'environnement, leur capacité à :
    • causer des maladies, et en particulier des maladies émergentes,
    • jouer des rôles bénéfiques dans les grands phénomènes environnementaux.
  • Notre travail est focalisé sur la bactérie Pseudomonas syringae. C'est un agent pathogène récurrent sur un large éventail de cultures d'importance majeure. Cette bactérie est aussi l'une des plus des actives, comme agent glacogène naturellement présent dans l'environnement. Son activité de nucléation de la glace - à des températures plus chaudes que la plupart des autres noyaux glacogènes - et sa capacité à monter dans les nuages via les courants d'air ont entrainé un grand intérêt dans son rôle éventuel dans les processus atmosphériques à l'origine de la pluviométrie.

Les pathogènes des plantes peuvent être hébergés dans des habitats agricoles et non agricoles et peuvent migrer entre ces différents types d'habitats. Ils peuvent également avoir des caractères utiles à leur adaptation à ces différents habitats ce qui peut les conduire à être impliqués dans divers phénomènes environnementaux. Pour la bactérie Pseudomonas syringae, nous étudions l'influence des habitats environnementaux sur l'émergence des maladies des plantes. Nous étudions également la dissémination de P. syringae via le cycle de l'eau et son influence sur les processus atmosphériques qui affectent les précipitations et la foudre.

  • Un des objectifs à long terme de notre travail est d'anticiper les échanges de souches pathogènes de P. syringae issues de réservoirs environnementaux avec les cultures et d'identifier les conditions les plus favorables pour l'émergence des maladies. Pour atteindre cet objectif, nous
    • identifier les réservoirs écologiques naturelles de P. syringae
    • déterminer le rôle de ces réservoirs dans l'évolution bactérienne
    • évaluer la probabilité de dissémination aux plantes cultivées
    • identifier les facteurs climatiques les plus favorables à la maladie.
  • L'autre objectif à long terme de notre travail est de définir des stratégies de gestion du paysage et des politiques qui concilient les deux rôles de micro-organismes, pathogènes pour les végétaux et bénéfiques pour les précipitations. Pour atteindre cet objectif, nous devons    
    • identifier les sources de microorganismes actifs glacogènes, qui sont aussi des agents pathogènes des plante
    •  évaluer le flux de ces microorganismes de la litière vers l'atmosphère
    • contribuer à la recherche sur le rôle des microorganismes dans la physique des nuages, y compris les processus liés à la pluviométrie, la foudre et de l'albédo
    • évaluer et cartographier l'intensité des réactions terre-atmosphère liées aux microorganismes.

SELECTION DE PUBLICATIONS

  • Aho K., Weber C., Christner B., Vinatzer B., Morris C.E., Joyce R., Failor K., Werth J., Bayless‐edwards A., Schmale D. 2020. Spatiotemporal patterns of microbial composition and diversity in precipitation. Ecological monographs 90(1): e01394. https://hal.inrae.fr/hal-02626506
  • Šantl-Temkiv, T., Sikoparija, B., Maki, T., Carotenuto, F., Amato, P., Yao, M., Morris, C.E., Schnell, R., Jaenicke, R., Pöhlker, C., Demott, P.J., Hill, T.C.J., Huffman, J.A. 2020. Bioaerosol field measurements: Challenges and perspectives in outdoor studies. Aerosol Science and Technology 54: 520-546. https://hal.inrae.fr/hal-02319383
  • Morris C.E., Lamichhane J.R., Nikolić, I., Stanković S., Moury B. 2019. The overlapping continuum of host range among strains in the Pseudomonas syringae complex. BMC Phytopathology Research 1 :4  https://hal.inrae.fr/hal-02621367
  • Morris C.E., Moury B. 2019. Revisiting the concept of host range of plant pathogens. Annu. Rev. Phytopathol. 57:63-90. https://hal.inrae.fr/hal-02299656
  • Omrani M., Roth M., Roch G., Blanc A., Morris C.E., Audergon J.M. 2019. Genome-wide association multi-locus and multi-variate linear mixed models reveal two linked loci with major effects on partial resistance of apricot to bacterial canker. BMC Plant Biol. 19 :31  https://hal.inrae.fr/hal-02621426
  • Parisi L., Morgaint B., Blanco Garcia J., Guilbaud, C., Chandeysson C., Bourgeay J.-F., Moronvalle A., Bru, L., Brachet M. L., Morris C.E.  2019. Bacteria from four phylogroups of the Pseudomonas syringae complex can cause bacterial canker of apricot. Plant Pathology 68 :1249–1258.  https://hal.inrae.fr/hal-02622425
  • Morris C.E. 2018. Phytobiomes contribute to climate processes that regulate temperature, wind, cloud cover and precipitation. Phytobiomes 2:55-6 1 https://hal.inrae.fr/hal-02624565
  • Leyronas C., Morris C.E., Choufani M., Soubeyrand S. 2018. Assessing the aerial interconnectivity of distant reservoirs of Sclerotinia sclerotiorum. Frontiers in Microbiology, section Extreme Microbiology 9 :  https://hal.inrae.fr/hal-02623334
  • Bardin M., Leyronas C., Troulet C., Morris C.E. 2018. Striking similarities between Botrytis cinerea from non-agricultural and from agricultural habitats. Frontiers in Plant Science, 9, 1820.  https://hal.inrae.fr/hal-01946288
  • Carotenuto F., Georgiadis T., Gioli B., Leyronas C., Morris C. E., Nardino M., Wohlfahrt G., Miglietta F. 2017 Measurements and modeling of surface–atmosphere exchange of microorganisms in Mediterranean grassland. Atmos. Chem. Phys. 17, 14919-14936  https://hal.inrae.fr/hal-01604418
  • Stopelli E., Conen F., Guilbaud C., Zopfi J., Alewell C., Morris C.E. 2017. Ice nucleators, bacterial cells and Pseudomonas syringae in precipitation at Jungfraujoch. Biogeosciences 14:1189-1196 https://hal.inrae.fr/hal-01594979
  • Morris C.E., Soubeyrand S., Bigg E.K., Creamean J.M., Sands D.C. 2017. Mapping rainfall feedback to reveal the potential sensitivity of precipitation to biological aerosols. Bull. Amer. Meteorol. Soc., 98, 1109-1118.  https://hal.inrae.fr/hal-02627944
  • Monteil C.L., Yahara K., Studholme D.J., Mageiros L., Méric G., Swingle B., Morris C.E., Vinatzer, B.A., Sheppard S.K. 2016. Population genomic insights into the emergence, crop-adaptation, and dissemination of Pseudomonas syringae pathogens. Microbial Genomics  https://hal.inrae.fr/hal-01602197
  • Morris, C.E., Conen, F., Alex Huffman, J., Phillips, V., Pöschl, U., Sands, D. C. 2014. Bioprecipitation: a feedback cycle linking earth history, ecosystem dynamics and land use through biological ice nucleators in the atmosphere. Global change biology, 20 (2), 341-51. https://hal.inrae.fr/hal-02637995
  • Morris C.E., Monteil C.L., Berge O. 2013. The life history of Pseudomonas syringae: linking agriculture to Earth system processes. Annu. Rev. Phytopath. 51:85-104. https://hal.inrae.fr/hal-02652198

 PUBLICATIONS TRÈS CITÉES

Christner B.C., Morris C.E., Foreman C.M., Cai, R., Sands D.C. 2008. Ubiquity of biological ice nucleators in snowfall. Science 319:1214. https://hal.inrae.fr/hal-02663388

Morris C.E., Monier J.-M. 2003. The ecological significance of biofilm formation by plant-associated bacteria. Annu. Rev. Phytopathol. 41:429-453. https://hal.inrae.fr/hal-02680984

Morris C.E., Sands D.C., Vinatzer B.A., Glaux C., Guilbaud C., Buffière A., Yan S., Dominguez H., Thompson B. 2008. The life history of the plant pathogen Pseudomonas syringae is linked to the water cycle. The ISME Journal, 2:321-334. https://hal.inrae.fr/hal-02666544

Ellison D., Morris C.E., Locatelli B., Sheil D., Cohen J., Murdiyarso D., Gutierrez V., van Noordwijk M., Creed I.F., Pokorny J., Gaveau D., Spracklen D., Bargués Tobella A., Ilstedt U., Teuling R., Gebrehiwot S.G., Sands D.C., Muys B., Verbist B., Springgay E., Sugandi Y., Sullivan C. 2017. Trees, forests and water: cool insights for a hot world. Global Environ. Change. 43 :51-61. https://hal.inrae.fr/hal-01517232

 POUR PLUS D'INFORMATION