INRAE PACA Unité de Recherches de Pathologie Végétale cm Domaine St Maurice BP 94 67, allée des chênes CS 60094 F84143 Montfavet cedex France Tel : 33 (0) 4.32.72.28.86 odile.berge(a)inrae.fr

Mes publications dans l'archive ouverte HAL INRAE https://www.researchgate.net/profile/Odile_Berge Portrait réalisé par le service de communication d'INRAE: Portrait d'Odile Berge, chercheuse au sein de l'unité Pathologie Végétale et nouvelle référente "Diversité-Egalité" du centre

Pseudomonas syringae et microorganismes eukaryotes en eau douce

• La bactérie phytopathogène, Pseudomonas syringae, à l’image des pathogènes humains dits "environnementaux" peut être soumise à des pressions de sélection autres que celles de l’interaction avec les plantes cultivées, lors de son périple dans les écosystèmes naturels.

• Pour comprendre les interactions biotiques que P. syringae établit avec d’autres organismes vivants, cette étude sera conduite dans un habitat important de la bactérie et récemment mis en évidence : les ruisseaux et rivières. Une des premières cibles visées par ce projet sont les biofilms épilithes qui se développent à l’interface eau-rochers. L’assemblage complexe de microorganismes très variés au sein de ces biofilms offre à P. syringae la possibilité d’interactions biologiques différentes de celles typiques des agrosystèmes.

• Oueslati, M., Mulet, M., Gomila, M., Berge, O., Hajlaoui, M. R., Lalucat, J., Sadfi-Zouaoui, N., García-Valdés, E. (2019). New species of pathogenic Pseudomonas isolated from citrus in Tunisia: Proposal of Pseudomonas kairouanensis sp. nov. and Pseudomonas nabeulensis sp. nov. Systematic and Applied Microbiology, 42 (3), 348-359. https://doi.org/10.1016/j.syapm.2019.03.002 
• Parisi, L., Brun, L., Berge, O., Borschinger, B., Lacroix, C., Chandeysson, C., Bourgeay, J.-F., Guilbaud, C., Gros, C., Combe, F., Morgaint, B., Haim, B., Chauvin-Buthaud, B., Morris, C. E. (2019). Chancre de l’abricotier : diversité bactérienne en verger. Phytoma, 727, 42-47.
• Parisi, L., Morgaint, B., Blanco Garcia, J., Guilbaud, C., Chandeysson, C., Bourgeay, J.-F., Moronvalle, A., Brun, L., Brachet, M. L., Morris, C. E. (2019). Bacteria from four phylogroups of the Pseudomonas syringae complex can cause bacterial canker of apricot. Plant Pathology, 68 (7), 1249–1258. https://doi.org/10.1111/ppa.13051
• Pédron J., Guyon L., Lecomte A., Blottiere L., Chandeysson C., Rochelle-Newall E., Raynaud X., Berge O., Barny M.A. (2020). Comparison of environmental and culture-derived bacterial communities through 16S metabarcoding: A powerful tool to assess media selectivity and detect rare taxa. Microorganisms 8(8): 1129. https://doi.org/10.3390/microorganisms8081129 
• Rousset, L., Alpha‐Bazin, B., Chateau, A., Armengaud, J., Clavel, T., Berge, O., Duport, C. (2020). Groundwater promotes emergence of asporogenic mutants of emetic Bacillus cereus. Environmental Microbiology, Accepted Author Manuscript. https://doi.org/10.1111/1462-2920.15203

• Voir la page "Mise en place d’un outil simple de classification et d’identification des bactéries du groupe Pseudomonas syringae" écrite par le service de communication d'INRAE (publication le 19/05/2015)
• Voir la page "Un cadre pour évaluer le potentiel d’émergence d’agents phytopathogènes" Lettre aux Entreprises - INRA, N° 74, Juin 2015.