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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Characterisation of novel secreted proteins and their potential role in cyst nematode parasitism

Vendredi 15 Novembre à 11h00 - Sophia Antipolis, Inra, Salle A010

Sebastian Eves-van den Akker, thésard à l'Université de Leeds, actuellement en stage dans l'équipe IPN, nous présentera ses travaux portant sur : "Characterisation of novel secreted proteins and their potential role in cyst nematode parasitism."

Abstract

Plant parasitic nematodes comprise several groups, the most economically damaging of these are the sedentary endoparasites, causing losses to agriculture worth in excess of £75 billion per year. Sedentary endoparasitic nematodes are obligate biotrophs and modify host root tissue, using a suite of effector proteins, to create a feeding site that is their sole source of nutrition. Genes potentially involved in the feeding process of the potato cyst nematode Globodera pallida have been identified through analysis of life-stage specific transcriptome sequences mapped to its recently assembled draft genome. Differential expression analysis coupled with signal peptide and transmembrane prediction enabled identification of a range of novel, putatively secreted proteins. A role in cyst nematode feeding has been implicated for one gene family whose members were found to be highly diverse between individuals of the same population. In situ hybridisation was used to demonstrate expression of this gene family in the amphid sheath cells of parasitic stages. These cells service the amphids, a structure that is the proposed origin of the feeding plug. Secretion of the encoded proteins has been confirmed using immunochemistry to localise them in host potato roots at the plant-nematode interface. Despite the variation in gene sequence between individual nematodes, in planta expression of double stranded RNA targeting a conserved region of the gene family results in approximately 70 % reduction in total nematode infection. Representatives of this gene family have been identified in other cyst nematode species but not in root-knot nematodes.

S. Eves-van den Akker1,2 (presenting author), C. J. Lilley2, J. T. Jones1 and P. E. Urwin2.

1.The James Hutton Institute, Invergowrie, DD2 5DA, Scotland
2.University of Leeds, Leeds, LS2 9JT, England