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INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Infrastructure - Biocontrôle et Biostimulation des Plantes, Equipements et Expertise

PlantBIOs propose, dans un cadre scientifique d’excellence, équipements et expertise pour des études du gène à l’agroécosystème avec des outils analytiques, des outils expérimentaux et des collections de ressources biologiques rares.

L'infrastructure Scientifique Collective PlantBIOs

Dans le domaine du biocontrôle et de la biostimulation des plantes, l’Institut Sophia Agrobiotech a ces dernières années engagé une structuration forte de ses outils et un partenariat actif avec le triple objectif :

d’accroître l’attractivité scientifique du site via de nouvelles structures matérielles et organisationnelles uniques en France ;
de développer des collaborations avec les entreprises afin d’assurer le transfert des résultats de la recherche ;
de développer la formation autour du biocontrôle.

PlantBIOs est ouvert à la communauté scientifique académique et privée à qui elle offre :

service, mise à disposition d’équipements et expertise ;
développements technologiques et méthodologique ;
formation.

Pour tout projet de prestation de service ou de collaborations de recherche,
merci de contacter PlantBIOs à l’adresse suivante : isa-plantbios@inrae.fr

Organisation et gouvernance

L'infrastructure PlantBIOs s’appuie sur une gouvernance collective et est engagée dans une démarche de management de la qualité.

Les missions des instances de gouvernance

• Le Collège de Direction de PlantBIOs (CODIR)

Le CODIR est en charge de l’arbitrage final interne à PlantBIOs sur les questions engageantes pour l’avenir de l’infrastructure : investissements exceptionnels, remontée de besoins de postes, définition de la politique d’accès, validation du budget prévisionnel.
Il définit annuellement la stratégie de l’infrastructure en termes d’évolutions technologiques et organisationnelles.
Il se réunit autant que de besoin et au moins 3 fois par an.
Il interagit directement avec le Collège de Direction et le Conseil Scientifique d’ISA sur les questions impactant l’unité.

• Le Conseil Scientifique d’Utilisation (CSU)

Chaque composante de PlantBIOs s’appuie sur un CSU. Le CSU a pour mission d’aiguiller les responsables des composantes sur les besoins des utilisateurs en termes d’évolutions techniques, de proposer des pistes pour la recherche de moyens afin d'accompagner ces évolutions et de contribuer aux choix des investissements. En cas de saturation de l’infrastructure, le CSU peut aussi être consulté pour prioriser les projets. Le CSU est composé de représentants des communautés d'utilisateurs et d’experts externes.

Une démarche qualité engagée

PlantBIOs est engagée dans une démarche qualité ISO 9001 qui se déploie à partir du périmètre déjà certifié du CRB Ep’Coll. Nos objectifs dans ce domaine sont déclinés dans notre Politique Qualité.

Les composantes de l'ISC

PlantBIOs constitue aujourd’hui une équipe qui s’appuie sur un collectif de 27 agents pour 15,7 ETP.

Responsable de l'ISC PlantBIOs

Karine HUGOT

Des outils analytiques regroupant compétences et équipements dans les domaines de la bioinformatique, la biochimie analytique l'imagerie cellulaire et le vidéo-phénotypage, et reconnus comme Plateforme par l’Inra (CNOC) depuis 2013 = PF SPIBOC ;

Biochimie Analytique
Le plateau de biochimie analytique de l’institut Sophia Agrobiotech (ISA) dispose d'un Biacore 3000 et d'un couplage LC-MS/MS. Il s’agit d’un outil collectif commun accessible à tout le personnel d’ISA et également ouvert à l’extérieur (académique et secteur privé - cf modalités d’accès). Ce plateau, mis en place en 2010, par l’ancienne UMR IBSV (Interactions Biotiques et Santé Végétale) est géré par Aurélie Séassau aidée par un référent scientifique.	Aurélie SEASSAU (Resp. op.) Georges DE SOUSA (Resp.Sc.)
BioInformatique et Génomique
Le plateau de bioinformatique a pour objectif de mutualiser les moyens et les compétences en bioinformatique de l'ISA afin de prendre en charge et d'optimiser le traitement des données des projets « omiques » de plus en plus nombreux. L'activité du plateau est centrée sur l'analyse de séquences dans le domaine des interactions entre plantes et bio-agresseurs ou symbiontes. Il mutualise ses efforts autour du développement de programmes et d'outils originaux pour répondre au mieux aux besoins des biologistes et aux questions scientifiques posées.	Corinne RANCUREL (Resp. op.) Etienne DANCHIN (Resp.Sc.) Martine DA ROCHA Arthur PERE
Imagerie Cellulaire
Le plateau d'imagerie cellulaire fait partie de l'Institut Sophia Agrobiotech (ISA) (Pôle Santé des Plantes-INRA PACA). Il est une composante de la plateforme Microscopie et Imagerie de la Côte d’Azur (MICA), labellisée par IBiSA et de la plateforme Santé des Plantes Interactions Biotiques Outils scientifiques Collectifs (SPIBOC), labellisée par la CNOC. Accessible à tout le personnel d'ISA, il a également vocation à accueillir des extérieurs (secteur public ou privé).	Olivier PIERRE (Resp. op.) Janice DE ALMEIDA ENGLER (Resp.Sc.)
Vidéo-Phénotypage
Le plateau de vidéo-phénotypage (PVP) vise à proposer des équipements et expertises en acquisition et analyses d’images/vidéos, à destination des équipes de l’unité mixte de recherche Institut Sophia Agrobiotech et de partenaires extérieurs, académiques ou privés. Ce plateau dispose de 4 des 15 pièces climatiques de la nouvelle installation PheHome. Les équipements de PheHome, dont ceux du plateau PVP (avec notamment trois stations d’acquisition vidéo haut débit), ont été financés par le CPER SABLES.	Silène LARTIGUE (Resp. op.) Vincent CALCAGNO (Resp.Sc.)

Des Collections de Ressources Biologiques rares de nématodes et trichogrammes, cette dernière collection étant labellisée IBiSA et certifiée ISO 9001 (Ep-Coll), les deux étant rattachées au pilier Environnement de Infrastructure de Recherche nationale RARe ;

Collections de Ressources Biologiques
L’Installation Expérimentale de l’ISA héberge également des collections de nématodes et un CRB (parasitoïdes oophages).	Nicolas RIS (Resp.Sc.) Sylvie WAROT

Une Installation Expérimentale (IE) identifiée par l’INRA (CNUE) en 2014 comprenant, pour la production de matériel biologique et l'expérimentation en conditions contrôlées, des pièces climatiques (dont certaines dédiées transgénèse), le bâtiment Entomopolis pour l'élevage d'insectes, des structures de quarantaine (insectes et nématodes) et des serres dont une S2 et un mésocosme.

Installation Expérimentale
L’UMR ISA, dispose d’un ensemble d’installations permettant des expérimentations en conditions contrôlées, qui lui permet d'étudier de multiples modèles biologiques de l'échelle de la cellule jusqu’à l'agro-écosystème.	Michela ION-SCOTTA (Resp. op.) Valérie ALLASIA (Ref. Tech. Trangénèse) Nicolas BOROWIEC (Ref. Tech. Entomopolis) Laurent KREMMER (Ref. Tech. Phéome) Nathalie MARTEU (Ref. Tech. P. Clim) Lionel SALVY ( Ref. Tech. Serres) Alexandra AUGUSTE José BAZZANO Marc BOSSENO Ulysse JULIEN-PORTIER Sylvain NUEE Gabriel ZIZZO