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Dernière mise à jour : Mai 2018

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RANCUREL Corinne

IE CNRS - Ingénieur d'études

RANCUREL Corinne
Plateau de BioInformatique et Génomique - BIG

2019

  • [25] Schiffer, P.H., Danchin, E.G.J., Burnell, A.M., Creevey, C.J., Wong, S., Dix, I., O’Mahony, G., Culleton, B.A., Rancurel, C., Stier, G., Martínez-Salazar, E.A., Marconi, A., Trivedi, U., Kroiher, M., Thorne, M.A.S., Schierenberg, E., Wiehe, T., Blaxter, M. Signatures of the evolution of parthenogenesis and cryptobiosis in the genomes of panagrolaimid nematodes.; iScience (2019). https://doi.org/10.1016/j.isci.2019.10.039
  • [24] Rancurel, C., van Tran, T., Elie, C., Hilliou, F. SATQPCR: Website for statistical analysis of real-time quantitative PCR data. Molecular and Cellular Probes. 46, 101418 (2019). https://doi.org/10.1016/j.mcp.2019.07.001
  • [23] Marmonier, A., Perfus-Barbeoch, L., Rancurel, C., Boissinot, S., Favery, B., Demangeat, G., Brault, V. In Vitro Acquisition of Specific Small Interfering RNAs Inhibits the Expression of Some Target Genes in the Plant Ectoparasite Xiphinema index. International Journal of Molecular Sciences. 20, 3266 (2019). https://doi.org/10.3390/ijms20133266

2018

  • [22] Pratx, L., Rancurel, C., Da Rocha, M., Danchin, E.G.J., Castagnone-Sereno, P., Abad, P., Perfus-Barbeoch, L. Genome-wide expert annotation of the epigenetic machinery of the plant-parasitic nematodes Meloidogyne spp., with a focus on the asexually reproducing species. BMC Genomics. 19, 321 (2018). https://doi.org/10.1186/s12864-018-4686-x
  • [21] Cottret, L., Briand, M.,Rancurel, C., Carrere, S. Family-Companion: analyse, visualise, browse, query and share your homology clusters. bioRxiv. 266742 (2018). https://doi.org/10.1101/266742

2017

  • [20] Rancurel, C., Legrand, L., Danchin, E.G.J. Alienness: Rapid Detection of Candidate Horizontal Gene Transfers across the Tree of Life. Genes. 8, 248 (2017). https://doi.org/10.3390/genes8100248
  • [19] Larousse, M., Rancurel, C., Syska, C., Palero, F., Etienne, C., Industri, B., Nesme, X., Bardin, M., Galiana, E. Tomato root microbiota and Phytophthora parasitica-associated disease. Microbiome. 5, 56 (2017). https://doi.org/10.1186/s40168-017-0273-7
  • [18] Danchin, E.G.J., Perfus-Barbeoch, L., Rancurel, C., Thorpe, P., Da Rocha, M., Bajew, S., Neilson, R., (Guzeeva), E.S., Da Silva, C., Guy, J., Labadie, K., Esmenjaud, D., Helder, J., Jones, J.T., Den Akker, S.E. The Transcriptomes of Xiphinema index and Longidorus elongatus Suggest Independent Acquisition of Some Plant Parasitism Genes by Horizontal Gene Transfer in Early-Branching Nematodes. Genes. 8, 287 (2017). https://doi.org/10.3390/genes8100287
  • [17] Blanc-Mathieu, R., Perfus-Barbeoch, L., Aury, J.-M., Da Rocha, M., Gouzy, J., Sallet, E., Martin-Jimenez, C., Bailly-Bechet, M., Castagnone-Sereno, P., Flot, J.-F., Kozlowski, D.K., Cazareth, J., Couloux, A., Da Silva, C., Guy, J., Kim-Jo, Y.-J., Rancurel, C., Schiex, T., Abad, P., Wincker, P., Danchin, E.G.J. Hybridization and polyploidy enable genomic plasticity without sex in the most devastating plant-parasitic nematodes. PLoS Genet. 13, e1006777 (2017). https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006777

2016

  • [16] Pratlong, M., Rancurel, C., Pontarotti, P., Aurelle, D. Monophyly of Anthozoa (Cnidaria): why do nuclear and mitochondrial phylogenies disagree? Zoologica Scripta. 46, 363–371 (2016). https://doi.org/10.1111/zsc.12208
  • [15] Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., Da Rocha, M., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, E., Montarry, J., Mimee, B., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., Jones, J.T. The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. Genome Biology. 17, 124 (2016). https://doi.org/10.1186/s13059-016-0985-1
  • [14] Damiani, I., Drain, A., Guichard, M., Balzergue, S., Boscari, A., Boyer, J.-C., Brunaud, V., Cottaz, S., Rancurel, C., Da Rocha, M., Fizames, C., Fort, S., Gaillard, I., Maillol, V., Danchin, E.G.J., Rouached, H., Samain, E., Su, Y.-H., Thouin, J., Touraine, B., Puppo, A., Frachisse, J.-M., Pauly, N., Sentenac, H. Nod Factor Effects on Root Hair-Specific Transcriptome of Medicago truncatula: Focus on Plasma Membrane Transport Systems and Reactive Oxygen Species Networks. Front. Plant Sci. 7, (2016). https://doi.org/10.3389/fpls.2016.00794

2014

  • [13] Pasquier, C., Clément, M., Dombrovsky, A., Penaud, S., Rocha, M.D., Rancurel, C., Ledger, N., Capovilla, M., Robichon, A. Environmentally Selected Aphid Variants in Clonality Context Display Differential Patterns of Methylation in the Genome. PLOS ONE. 9, e115022 (2014). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0115022
  • [12] Eves-van den Akker, S., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J.,Rancurel, C., Cock, P.J.A., Urwin, P.E., Jones, J.T. The Transcriptome of Nacobbus aberrans Reveals Insights into the Evolution of Sedentary Endoparasitism in Plant-Parasitic Nematodes. Genome Biol Evol. 6, 2181–2194 (2014). https://doi.org/10.1093/gbe/evu171

2010

  • [11] Lombard, V., Bernard, T., Rancurel, C., Brumer, H., Coutinho, P.M., Henrissat, B. A hierarchical classification of polysaccharide lyases for glycogenomics. Biochem J. 432, 437–444 (2010). https://doi.org/10.1042/BJ20101185

2009

  • [10] Romero, P.R., Rancurel, C., Khosravi, M., Dunker, A.K., Karlin, D. Intrinsic Disorder and the Evolution of Viral Overlapping Genes. Biophysical Journal. 96, 221a (2009). https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.1923
  • [9] Rancurel, C., Khosravi, M., Dunker, A.K., Romero, P.R., Karlin, D. Overlapping Genes Produce Proteins with Unusual Sequence Properties and Offer Insight into De Novo Protein Creation. Journal of Virology. 83, 10719–10736 (2009). https://doi.org/10.1128/JVI.00595-09
  • [8] Coutinho, P.M., Rancurel, C., Stam, M., Bernard, T., Couto, F.M., Danchin, E.G.J., Henrissat, B. Carbohydrate-Active Enzymes Database: Principles and Classification of Glycosyltransferases. In: Bioinformatics for Glycobiology and Glycomics. pp. 89–118. John Wiley & Sons, Ltd (2009) https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470029619.ch5
  • [7] Cantarel, B.L., Coutinho, P.M., Rancurel, C., Bernard, T., Lombard, V., Henrissat, B. The Carbohydrate-Active EnZymes database (CAZy): an expert resource for Glycogenomics. Nucleic Acids Res. 37, D233–D238 (2009). https://doi.org/10.1093/nar/gkn663

2008

  • [6] Weiner, R.M., Ii, L.E.T., Henrissat, B., Hauser, L., Land, M., Coutinho, P.M., Rancurel, C., Saunders, E.H., Longmire, A.G., Zhang, H., Bayer, E.A., Gilbert, H.J., Larimer, F., Zhulin, I.B., Ekborg, N.A., Lamed, R., Richardson, P.M., Borovok, I., Hutcheson, S. Complete Genome Sequence of the Complex Carbohydrate-Degrading Marine Bacterium, Saccharophagus degradans Strain 2-40T. PLOS Genetics. 4, e1000087 (2008). https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000087
  • [5] Levasseur, A., Piumi, F., Coutinho, P.M., Rancurel, C., Asther, M., Delattre, M., Henrissat, B., Pontarotti, P., Asther, M., Record, E. FOLy: An integrated database for the classification and functional annotation of fungal oxidoreductases potentially involved in the degradation of lignin and related aromatic compounds. Fungal Genetics and Biology. 45, 638–645 (2008). https://doi.org/10.1016/j.fgb.2008.01.004

2006

  • [4] Stam, M.R., Danchin, E.G.J., Rancurel, C., Coutinho, P.M., Henrissat, B. Dividing the large glycoside hydrolase family 13 into subfamilies: towards improved functional annotations of α-amylase-related proteins. Protein Eng Des Sel. 19, 555–562 (2006). https://doi.org/10.1093/protein/gzl044

2005

  • [3] Ferron, F.#, Rancurel, C.#, Longhi, S., Cambillau, C., Henrissat, B., Canard, B. VaZyMolO: a tool to define and classify modularity in viral proteins. Journal of General Virology,. 86, 743–749 (2005). https://doi.org/10.1099/vir.0.80590-0  [ #  equal contribution]

2004

  • [2] Egloff, M.-P., Ferron, F., Campanacci, V., Longhi, S., Rancurel, C., Dutartre, H., Snijder, E.J., Gorbalenya, A.E., Cambillau, C., Canard, B. The severe acute respiratory syndrome-coronavirus replicative protein nsp9 is a single-stranded RNA-binding subunit unique in the RNA virus world. PNAS. 101, 3792–3796 (2004). https://doi.org/10.1073/pnas.0307877101

2003

  • [1] Campanacci, V., Egloff, M.-P., Longhi, S., Ferron, F., Rancurel, C., Salomoni, A., Durousseau, C., Tocque, F., Brémond, N., Dobbe, J.C., Snijder, E.J., Canard, B., Cambillau, C. Structural genomics of the SARS coronavirus: cloning, expression, crystallization and preliminary crystallographic study of the Nsp9 protein. Acta Cryst D. 59, 1628–1631 (2003). https://doi.org/10.1107/S0907444903016779

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