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Formation

Expérience professionnelle

Intérêt scientifique

Mon intérêt scientifique est d’identifier les mécanismes moléculaires conduisant chez la plante à la sensibilité aux oomycètes pathogènes. Le laboratoire effectue ses recherches dans les domaines de la génomique fonctionnelle, de la génétique, de la biochimie, et de la biologie moléculaire et cellulaire. Les études se focalisent sur deux systèmes biologiques d’interaction, utilisant la plante modèle Arabidopsis thaliana en tant que hôte pour identifier des fonctions végétales manipulées par :

• Hyaloperonospora arabidopsidis, un oomycète biotrophe obligatoire provoquant le mildiou sur feuilles. Cet agent pathogène est spécialisé sur sa plante hôte Arabidopsis.
• Phytophthora parasitica, un oomycète hémi-biotrophe qui attaque les racines d’Arabidopsis. Cet agent pathogène est très polyphage. Il initié l’infection par une phase biotrophe et déclenche ensuite la mort des cellules végétales.

Nous effectuons l’analyse fonctionnelle de différents gènes d’A. thaliana dont le niveau d’expression affecte l’interaction avec H. arabidopsidis. Il s’agit de deux gènes codant des « leucine-rich repeat receptor-like kinases » (LRR-RLKs), un gène codant un régulateur négatif putative de la mort cellulaire, un gène codant une protéine associée aux microtubules et impliquée dans la mitose, et deux gènes codant des transférases dont une UDP-glucosyltransférase et une methyltransférase impliquée dans la synthèse des monolignols (COMT1).

Le pathosystème modèle entre A. thaliana et Phytophthora parasitica a été établi au laboratoire. Il s’agit du premier pathosystème impliquant la plante modèle et un oomycète hémibiotrophe racinaire. L’interaction compatible est caractérisé par une phase de biotrophie prolongé, qui est essentielle pour le cycle de vie de P. parasitica, mais difficilement observable durant l’infection de l’hôte naturelle, la tomate. Pour décrire le transcriptôme des racines infectées à différents stades, dès le début de la pénétration jusqu’à la phase du déclenchement de la nécrotrophie, des analyses du transcriptome ont été effectuées et l’analyse fonctionnelle de différents gènes identifiés est en cours.

Programmes de recherche

• Projets de l’Agence National de Recherche (ANR) : ANR Génoplante AFINDIS  2006-2008, et ANR Génomique SCRIPS 2009-2012. L’objectif était d’identifier des cibles végétales communes pour les oomycètes, le nématode Meloidogyne incognita, et la bactérie Ralstonia solanacearum.
• Valorisation (Génoplante-Valor, 2011-2013). Ce programme vise à montrer, sur la plante modèle tomate, que l’inactivation par une approche de TILLING d’un gène, dont l’orthologue a été identifié chez Arabidopsis, permettra d’obtenir une résistance accrue, non-spécifique et durable chez une plante d’intérêt agronomique.
• Le projet « cibles moléculaires végétales des oomycètes pathogènes » est intégré dans le LabEx « Signalife ».

Enseignement

Cours et TD spécialisés dans le cadre du Master Biologie des Adaptations, Module Interactions Plantes-Bioagresseurs, Université Nice-Sophia Antipolis (depuis 2004). Invitations fréquentes d’autres Universités françaises (Toulouse, Rouen) pour des séminaires spécialisées dans les cadre des programmes de Master.

Membres du Laboratoire

• Valerie Allasia, TR INRA
• Etudiants en Master et Thèse

Expertises

• Membre de commissions nationales et internationales d’experts d’évaluation (ANR France, DFG Allemagne, NOW Pays Bas, FWF Autriche).
• Membre des Commissions d’Evaluation de Chercheurs (CSS) et d’Unités de Recherche (AERES).
• Président du Conseil Scientifique du LabEx « Signalife ».
• Reviewer d’articles scientifiques pour Plant Journal, Plant Physiology, Mol. Plant Microbe Interact., etc.
• Organisation de trois FOR666 Annual Meetings on Compatibility Mechanisms (2006, 2009, et 2011) à Sophia Antipolis.
• Membre du Conseil Scientifique des Journées Jean Chevaugeon: Rencontres de Mycologie-Phytopathologie (depuis 2011).

Publications/Brevets recents et significatifs

• Galli M, Jacob S, Zheng Y, Ghezellou P, Gand M, Albuquerque W, Imani J, Allasia V, Coustau C, Spengler B, Keller H, Thines E, Kogel K-H (2023). MIF-like domain containing protein orchestrates cellular differentiation and virulence in the fungal pathogen Magnaporthe oryzae. iScience 26, 107565. https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.107565
• Giordano L, Schimmerling M, Panabières F, Allasia V, Keller H (2022). The exodomain of the impaired oomycete susceptibility 1 receptor mediates both endoplasmic reticulum stress responses and abscisic acid signalling during downy mildew infection of Arabidopsis. Mol Plant Pathol, 23, 1783-1791.https://doi.org/10.1111/mpp.13265
• Giordano L, Allasia V, Cremades A, Hok S, Panabières F, Bailly-Maître B, Keller H (2022). A plant receptor domain with functional analogies to animal malectin disables ER stress responses upon infection. iScience 25, 103877. https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.103877
• Gruner K, Leissing F, Sinitski D, Thieron H, Axstmann C, Baumgarten K, Reinstädler A, Winkler P, Altmann M, Flatley A, Jaouannet M, Zienkiewicz K, Feussner I, Keller H, Coustau C, Falter-Braun P, Feederle R, Bernhagen J, Panstruga R (2021). Chemokine-like MDL proteins modulate flowering time and innate immunity in plants. J Biol Chem 296, 100611. https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.100611
• Lebeaupin C, Blanc M, Vallée D, Keller H, Bailly-Maitre B (2020). BAX inhibitor-1: between stress and survival. FEBS J. 287, 1722-1736. https://doi.org/10.1111/febs.15179
• Jaouannet M, Pavaux AS, Pagnotta S, Pierre O, Michelet C, Marro S, Keller H, Lemée R, Coustau C (2020). Atypical membrane-anchored cytokine MIF in a marine dinoflagellate. Microorganisms 8, 1263. https://doi.org/10.3390/microorganisms8091263
• Testi S, Kuhn M-L, Allasia V, Auroy, P, Kong F, Peltier G, Pagnotta S, Cazareth J, Keller H, Panabières F (2019). An oomycete effector impairs autophagy in evolutionary distant organisms and favors host infection. bioRxiv https://doi.org/10.1101/697136
• Michelet C, Danchin EGJ, Jaouannet M, Bernhagen J, Panstruga R, Kogel KH, Keller H, Coustau C (2019). Cross-kingdom analysis of diversity, evolutionary history and site selection within the eukaryotic MIF protein superfamily. Genes 10, 740.
• Allasia V, Industri B, Ponchet M, Quentin M, Favery B, Keller H (2018). Quantification of salicylic acid (SA) and SA-glucosides in Arabidopsis thaliana. Bio-Protocol 8, 1-8.
• Le Berre JY, Gourgues M, Samans B, Keller H, Panabières F, Attard A (2017). Transcriptome dynamic of Arabidopsis roots infected with Phytophthora parasitica identifies VQ29, a gene induced during the penetration and involved in the restriction of infection. PLoS One 12, e0190341.
• Hanemian M, Barlet X, Sorin C, Yadeta KA, Keller H, Favery B, Simon R, Thomma BPHJ, Hartmann C, Crespi M, Marco Y, Tremousaygue D, Deslandes L (2016). Arabidopsis CLAVATA1 and CLAVATA2 receptors contribute to Ralstonia solanacearum pathogenicity through a miR169-dependent pathway. New Phytol 211, 502-515.
• Quentin M, Baurès I, Hoefle C, Caillaud MC, Allasia V, Panabières F, Abad P, Hückelhoven R, Keller H, Favery B (2016).  The Arabidopsis microtubule-associated protein MAP65-3 supports infection by filamentous biotrophic pathogens
• Naessens E, Dubreuil G, Giordanengo P, Baron OL, Minet-Kebdani N, Keller H, et Coustau C (2015). A secreted MIF cytokine enables aphid feeding and represses plant immune responses. Curr. Biol. 25, 1898-1903.
• Hok S, Allasia V, Andrio E, Naessens E, Ribes E, Panabières F, Attard A, Clément M, Barlet X, Marco Y, Grill E, Eichmann R, Weis C, Hückelhoven R, Ammon A, Ludwig-Müller J, Voll LM, Keller H (2014). The receptor kinase Impaired Oomycete Susceptibility 1 attenuates abscisic acid responses in Arabidopsis. Plant Physiol. 166, 1506-1518.
• Koch A, Kumar N, Weber L, Keller H, Imani J, Kogel KH (2013). Host-induced gene silencing of cytochrome P450 lanosterol C14α-demethylase-encoding genes confers strong resistance to Fusarium species. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 110, 19324-19329.
• Mosher S, Seybold H, Rodriguez P, Stahl M, Davies KA, Dayaratne S, Morillo S, Wierzba M, Favery B, Keller H, Tax FE, Kemmerling B (2012). The Tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify Arabidopsis immunity to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner. Plant J. 73, 469-482.
• Rodiuc N, Marco Y, Favery B, et Keller H (2012). Plants resistant to pathogens and methods for production thereof. Brevet WO/2012/017067.
• Hok S, Danchin EG, Allasia V, Panabières F, Attard A, et Keller H (2011). An Arabidopsis (malectin-like) leucine-rich repeat receptor-like kinase contributes to downy mildew disease. Plant Cell Environ.34, 1944-1957.
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• Hok S, Attard A, et Keller H (2010). Getting the most from the host: how pathogens force plants to cooperate in disease. Mol. Plant-Microbe Interact.23, 1253–1259.
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• Quentin M, Allasia V, Pegard A, Allais F, Ducrot PH, Favery B, Levis C, Martinet S, Masur C, Ponchet M, Roby D, Schlaich NL, Jouanin L, et Keller H (2009). Imbalanced lignin biosynthesis promotes the sexual reproduction of homothallic oomycete pathogens. PLoS Pathog.5, e1000264.
• Attard A, Gourgues M, Galiana E, Panabières F, Ponchet M, et Keller H (2008). Strategies of attack and defense in plant-oomycete interactions, accentuated for Phytophthora parasitica Dastur (syn.P. nicotianaeBreda de Haan). J. Plant Physiol.165, 83-94.
• Hernández-Blanco C, Feng DX, Hu J, Sánchez-Vallet A, Deslandes L, Llorente F, Berrocal-Lobo M, Keller H, Barlet X, Sánchez-Rodríguez C, Anderson LK, Somerville S, Marco Y, et Molina A (2007). Impairment of cellulose synthases required for Arabidopsis secondary cell wall formation enhances disease resistance. Plant Cell 19, 890-903.
• Racapé J, Belbahri L, Engelhardt S, Lacombe B, Lee J, Lochman J, Marais A, Nicole M, Nürnberger T, Parlange F, Puverel S, et Keller H (2005). Ca2+-dependent lipid binding and membrane integration of PopA, a harpin-like elicitor of the hypersensitive response in tobacco.Mol. Microbiol.58, 1406–1420.
• Belbahri L, Boucher C, Candresse T, Nicole M, Ricci P, et Keller H (2001). A local accumulation of theRalstonia solanacearumPopA protein in transgenic tobacco renders a compatible plant-pathogen interaction incompatible. Plant J.28, 419-430.
• Keller H, Pamboukdjian N, Ponchet M, Poupet A, Delon R, Verrier JL, Roby D, et Ricci P (1999). Pathogen-induced elicitin production in transgenic tobacco generates a hypersensitive response and nonspecific disease resistance. Plant Cell11, 223-236.