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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Institut Sophia Agrobiotech

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UMR INRA - Univ. Nice Sophia Antipolis - Cnrs
Inra PACA
400 route des chappes
BP 167
0690 Sophia Antipolis Cedex
FRANCE
Tel. : +33(0)4 92 38 64 00
Fax : + 33(0)4 92 38 64 01

http://www.paca.inra.fr/institut-sophia-agrobiotech

Doctorat - Thèse

Le doctorat se prépare en trois ans après un master (bac +8). Point d'aboutissement des études supérieures, le doctorat est une formation à et par la recherche. Le Doctorat prépare pour les métiers de la recherche et de l’enseignement supérieur.

Le parcours doctorat est composé de 6 semestres. Au cours de ces 6 semestres, l’étudiant mène des travaux de recherche au sein des laboratoires de l’université ou des laboratoires associés (INRA, INSERM, CEA, ...). Ces travaux aboutissent à la rédaction d’une thèse. En parallèle des travaux de recherche, l’étudiant suit au minimum 100H d’enseignement, réparties en modules de 25 heures chacun (2 modules par an).
 
 Par conséquent, les étudiants peuvent effectuer une thèse de Doctorat au sein des laboratoires de l'Institut Sophia Agrobiotech de l’INRA PACA à Sophia Antipolis, dans une thématique spécialement dédiée au végétal en interaction avec des organismes symbiotiques et pathogènes. 
 
 Promouvoir une agriculture moins dépendante d'une phytoprotection chimique, tout en préservant sa compétitivité, est devenu un enjeu national et européen dans le contexte du développement durable et de la préservation de la biodiversité. Le pôle a pour objectif de mobiliser des compétences pluridisciplinaires pour proposer des solutions nouvelles de maîtrise des bioagresseurs fondées sur la compréhension de leurs interactions avec les cultures, de l'évolution de leurs populations, de leurs relations avec le reste de l'écosystème cultivé et du fonctionnement des systèmes de culture.

Les thèses de l'unité sont consultables ci dessous :

Thèses en cours

RANTY-ROBY Sarah

Caractérisation des cibles d'effecteurs du parasitisme des nématodes à galles chez la tomate

IPN

s318433

01.12.2021

NJEKETE Cliven

Multi-target biocontrol plants to manage multi-species attack on tomato agrosystems

CEA; IPN

01.11.2021

BENJAMIN Goodluck

Analyse de l'interaction tripartite légumineuses, bactéries symbiotiques fixatrices d'azote et pucerons

ESIM; SYMBIOSE

s312959

01.10.2021

FICHANT Arnaud

Caractérisation in vivo de la virulence de Bacillus cereus et Bacillus thuringiensis chez le modèle Drosophila melanogaster

BES

s339645

01.10.2021

LUPATELLI Carlotta Aurora

A venir

IPO

01.10.2021

NAZARET Fanny

Caractérisation de nouvelles voies de régulation redox de Sinorhizobium meliloti impliquées dans la symbiose fixatrice d'azote avec Medicago truncatula

SYMBIOSE

s339700

01.10.2021

COINTE Mélina

Trichomove : du comportement au mouvement à la dispersion. Etude expérimentale et modélisation de la diffusion spatiale des parasitoïdes du genre Trichogramma.

M2P2

s313440

01.10.2020

GUICHARNAUD Chloé

Caractéristiques démographiques et génétiques des vagues d’expansion tirées et poussées : des systèmes expérimentaux aux populations naturelles

BPI

01.10.2020

SOULE Salomé

Développement de nouvelles résistances aux nématodes à galles: caractérisation des cibles d'effecteurs du parasitisme chez la tomate

IPN

s319309

01.10.2020

BOUT Alexandre

Adaptation des Parasitoïdes oophages à leur(s) hôte(s) : à travers l'étude des facteurs de virulence

ESIM; RDLB

s320948

28.09.2020

MA Ruo-Han

Bottom-up effects of irrigation and fertilization on aphid food webs in agro-ecosystems

CEA

14.01.2020

CLIN Pauline

Immunity and Mathematical Modelling to "Unify" Epidemiology

M2P2

01.01.2020

TLEISS Fatima

Etude des conséquences physiologiques induites par un surnombre de cellules entéroendocrines suite à l'ingestion d'aliments traités par Bt chez Drosophila melanogaster

BES

s319528

20.02.2019

BELLIARDO Carole

Exploiter les métagénomes du sol pour comprendre l'évolution et l'écologie des espèces associées aux plantes

GAME

s312927

15.10.2019

CHAMMAKHI Chaïma

Approches génétiques et fertilisation biologique pour l'amélioration des rendements des cultures de fèverole sous condition de stress hydrique

SYMBIOSE

01.10.2019

MICLON Morgane

Les macro-algues : une opportunité pour le contrôle des nématodes parasites des productions végétales et animales

IPN

s238943

24.09.2019

KONAN Kouassi Arthur Jocelin

Integrated pest management of the invasive species Tuta absoluta on tomato in Ivory Coast.

CEA

00.00.2019

AUGUSTE Alexandra

Synergie potentielle entre deux stratégies combinées exploitant l'effet Allee et Wolbachia sur l'extinction de populations expérimentales de Drosophila suzukii

BPI

s316652

01.11.2018

Thèses soutenues

JOLY Aurélia

Rôle des gènes Polycomb dans l'homéostasie intestinale et impact des bioinsecticides Bt sur le développement de pathologies inflammatoires de l'intestin

BES

s315380

28.10.2022

HACHFI Salma

Destin et comportement des spores du groupe Bacillus cereus chez des organismes modèles

BES

2022COAZ6003

16.03.2022

AMEZIAN Dries

Utilisation du modèle cellulaire de la légionnaire d'automne, Spodoptera frugiperda, les cellules Sf9 pour étudier le rôle de facteurs de transcription sur l'expression des gènes de détoxification en réponse aux xénobiotiques

ID

2022COAZ6000

20.01.2022

FOTSO FOTSO Yves

Modelling, analysis and control of coffee berry borer

M2P2

tel-03608463

17.01.2022

NOUREDDINE Yara

Caractérisation des régulations post-transcriptionnelles intervenant lors de la formation des cellules géantes induites par les nématodes à galles

IPN

2021COAZ6036

16.12.2021

HASSANALY GOULAMHOUSSEN Rahim

Étude de l’implication des mécanismes épigénétiques chez le nématode à galles Meloidogyne incognita

IPN

2021COAZ6032

13.12.2021

PASQUIER Antoine

De la preuve de concept à l’optimisation - l’utilisation d’une espèce d’acarien prédateur pour contrôler la population de la Chrysomèle des racines du Maïs (Diabrotica virgifera virgifera) (LeConte, 1868)

BPI

2021COAZ6028

10.12.2021

AUBREE Flora

Adaptation dans un monde en mouvement - adaptation des communautés et relations biodiversité-fonctionnement des écosystèmes, hétérogénéité spatiale et évolution de la tolérance au stress, migration pulsée et adaptation locale

M2P2

2021COAZ6023

08.11.2021

KANSO Hussein

Réduction de modèle, estimation des paramètres pour une population de génotypes et analyse du contrôle génétique : Cas du métabolisme des sucres dans la pêche

M2P2

2021AVIG0727

25.05.2021

TANKAM CHEDJOU Israel

Modelling, analysis and control of plantain plant-parasitic nematodes

M2P2

tel-03217816

09.04.2021

MURU David

Solution miracle ou coup dans l’eau ? Potentiel et limites de l’utilisation des programmes de lutte biologique en écologie expérimentale

BPI

2021COAZ6008

26.03.2021

LARTIGUE Silène

Intérêts du phénotypage de la personnalité pour améliorer la lutte biologique : cas d’étude chez l’auxiliaire Trichogramma evanescens

BPI

2021UBFCK016

17.03.2021

JNEID Rouba

Effet des bioinsecticides à base de Bacillus thuringiensis sur la physiologie intestinale de la Drosophile

BES

2021COAZ6003

21.01.2021

WANG Yusha

Contrôle biologique par conservation effets des plantes non cultivées sur les communautés d'arthropodes inféodées aux agrosystèmes

CEA

2020COAZ6047

16.12.2020

NILUSMAS Samuel

Gestion durable des nématodes à galles en culture maraîchère par la modélisation et l’optimisation du déploiement de variétés résistantes

M2P2

2020COAZ4086

10.12.2020

SYSKA Camille

Les systèmes Toxine-Antitoxine VapBC : des régulateurs de la symbiose fixatrice d'azote Rhizobium-Légumineuse

SYMBIOSE

2020COAZ6029

18.11.2020

KOZLOWSKI Djampa

Contribution des éléments transposables à l’adaptabilité de ravageurs de cultures en absence de reproduction sexuée

IPN

2020COAZ6028

13.11.2020

YANG Li

Régulation de la sénescence des nodules chez Medicago truncatula

SYMBIOSE

2020COAZ6022

30.09.2020

MEJIAS Joffrey

Analyse fonctionnelle de cibles végétales d’effecteurs du parasitisme du nématode Meloidogyne incognita impliquées dans l’ontogénèse des cellules géantes. Université Côte d'Azur, 2020. Français. {http://www.theses.fr/2020COAZ6018}

IPN

2020COAZ6018

24.09.2020

PANDHARIKAR Gaurav

Symbiose fixatrice d'azote versus nutrition minérale azotée : conséquence sur l'interaction entre Medicago truncatula et le puceron du pois Acyrthosiphon pisum

SYMBIOSE

2020COAZ6005

15.06.2020

GIORDANO Laïla

Le récepteur IOS1 d’Arabidopsis thalisana - modulateur de l’homéostasie protéique du réticulum endoplasmique en réponse au stress biotique

IPO

2019AZUR6023

16.12.2019

QU Yanyan

Interactions indirectes médiées par la plante sous contraintes biotiques multiples

CEA

2019AZUR6035

09.12.2019

LUO Chen

Effets écologiques et physiologiques des endosymbiotes facultatifs dans la résistance aux guêpes parasitoïdes et l'immunité des pucerons

ESIM

2019AZUR6019

03.12.2019

VAN GHELDER Cyril

Le locus de résistance Ma des Prunus vis-à-vis des nématodes à galles : Originalité structurale et évolution dans la famille des NBS-LRRs chez les plantes

IPN

2019AZUR6006

15.10.2019

THOMINE Eva

Effet de la diversification spatiale et temporelle des cultures à l’échelle du paysage agricole sur le biocontrôle et les ravageurs de culture

CEA

2019AZUR6032

17.09.2019

CABRAL DO NASCIMENTO Danila

La biogenèse des galles induites par des phyto-nématodes dépend de l'hyperactivation du cycle cellulaire : études fonctionnelles des nouveaux acteurs du cycle mitotique et de l'endocycle dans les cellules géantes

IPN

2019AZUR6001

12.09.2019

ION SCOTTA Michela

Distributions des espèces du genre Trichogramma le long d’un gradient altitudinal et adaptations locales aux basses températures chez l’espèce Trichogramma cacoeciae

RDLB

2019AZUR4035

29.05.2019

ZOTTA MOTA Ana Paula

A study of molecular responses to abiotic and biotic stresses in Arachis

IPN

10183/202671

13.05.2019

HAOND Marjorie

Impact de la capacité de charge de l’environnement sur les dynamiques d’expansions de métapopulation : théories et applications à un système expérimental hôte-parasitoïde

BPI

2019AZUR4017

26.03.2019

KIM Chami

Réponse immunitaire de la drosophile à la guêpe endoparasitoïde Leptopilina boulardi : caractérisation d’une réaction de résistance

ESIM

2019AZUR4008

22.03.2019

BERGER Antoine

Contribution des phytoglobines et des nitrate réductases à la régulation de l’oxyde nitrique et de la fixation de l’azote dans la symbiose Medicago truncatula / Sinorhizobium meliloti

SYMBIOSE

2019AZUR4006

12.03.2019

BURTE Victor

Étude des stratégies de mouvement chez les parasitoïdes du genre Trichogramma : apports des techniques d’analyse d’images automatiques

M2P2

2018AZUR4223

14.12.2018

MICHELET Claire

Analyse évolutive et fonctionnelle des Macrophage Migration Inhibitory Factors chez les eucaryotes

ID

2018AZUR4109

30.11.2018

MONTICELLI Lucie

Étude des facteurs écologiques modulant les gammes d’hôtes des parasitoïdes

CEA

2018AZUR4086

30.10.2018

TESTI Serena

L’effecteur Avh195 de Phytophthora parasitica : antagoniste de l’autophagie chez l’hôte et promoteur du processus infectieux

IPO

2018AZUR4087

26.10.2018

NGUYEN Van Chung

Diversité génétique du nématode vecteur Xiphinema index sur vigne et application pour optimiser la stratégie de résistance

IPN

2018AZUR4079

23.10.2018

DAMIEN Maxime

Favoriser les ennemis naturels de ravageurs par la diversité végétale dans un contexte hivernal

CEA

2018REN1B027

04.10.2018

ROVERE Martina

Étude fonctionnelle de la famille des facteurs de transcription ERF-VIIs chez Medicago truncatula : régulateurs clés de l’adaptation au manque d’oxygène

SYMBIOSE

2018AZUR4037

19.06.2018

CAVIGLIASSO Fanny

Interaction immunitaire dans un modèle Drosophiles-parasitoïde : effet de la température et potentiel évolutif du venin en lien avec l’espèce hôte

ESIM

2017AZUR4134

22.12.2017

WAN Bin

Interactions Drosophiles-guêpes endoparasitoïdes : rôle des vésicules extracellulaires du venin de Leptopilina boulardi dans le transport de facteurs de virulence et la spécificité d’hôte

ESIM

2017AZUR4143

21.12.2017

NGUYEN Le Thu Ha

Effet bottom-up du stress hydrique sur la gamme d’hôtes des parasitoïdes de pucerons

CEA

2017AZUR4132

20.12.2017

MASSARDIER-GALATA Lauriane

Succès de la reproduction de prédateurs en contexte de changements climatiques et de la dynamique océanique – Application aux « central place foragers » des zones australes, approche par la modélisation individu centrée

CEA

2017AZUR4050

10.07.2017

QUAGLIETTI Bastien

Impact de la consanguinité et de l’hybridation chez quatre auxiliaires de lutte biologique

BPI

2017AZUR4048

10.07.2017

BAJEUX Nicolas

Modélisation de stratégies d'introduction de populations, effets Allee et stochasticité

RDLB

2017AZUR4056

07.07.2017

MEDINA Clémence

Caractérisation des petits ARN régulateurs impliqués dans la formation des cellules géantes induites par les nématodes phytoparasites du genre Meloidogyne

IPN

2017AZUR4046

03.07.2017

PRATX Loris

Identification de marques épigénétiques chez le nématode à galles parasite de plantes Meloidogyne incognita

IPN

2017AZUR4026

04.05.2017

TRUONG Nhat My

Analyse fonctionnelle des effecteurs nucléaires du parasitisme des nématodes à galle Meloidogyne incognita et caractérisation de leurs cibles végétales

IPN

2016AZUR4149

20.12.2016

NAESSENS Elodie

Rôle des cytokines MIF dans l'interaction entre le puceron et sa plante hôte

ID

2016AZUR4145

16.12.2016

NGUYEN Chinh Nghia

Étude de la régulation du transcriptome de nématodes parasites de plante, les nématodes à galles du genre Meloidogyne

IPN

2016AZUR4124

08.12.2016

LOUDHAIEF Rihab

Effets des bioinsecticides à base de Bacillus thuringiensis sur la physiologie intestinale de la Drosophile

BES

2016AZUR4054

07.09.2016

LAROUSSE Marie

Étude de l’interaction entre Phytophthora parasitica et le microbiote rhizosphérique à la surface de la plante hôte Solanum lycopersicum

IPO

2016NICE4038

01.07.2016

ROUSSEAU Elsa

Effet de la dérive génétique et de la sélection sur la durabilité de la résistance des plantes aux virus

M2P2

2016NICE4024

27.05.2016

MOREL JOURNEL Thibaut

Stratégies d'introduction d'organismes dans un environnement spatialement structuré

BPI

2015NICE4107

09.12.2015

AL KHATIB Fadel

Apports de la biologie moléculaire à la systématique, biogéographie et écologie des espèces euroméditerranéennes du genre Eupelmus : implications pour leur utilisation en lutte biologique

RDLB

2015NSAM0024

20.11.2015

LIPUMA Justine

Rôle des systèmes toxine antitoxine de Sinorhizobium meliloti au cours de l’interaction symbiotique avec Medicago sp.

SYMBIOSE

2015NICE4044

06.07.2015

BARBARY Arnaud

Bases génétiques de la résistance vis-à-vis des nématodes du genre Meloidogyne chez le piment

IPN

2014NICE4120

10.12.2014

MALLEZ Sophie

Invasion du nématode du pin Bursaphelenchus xylophilus

IPN

2014NICE4099

02.12.2014

MATHE-HUBERT Hugo

Variation et évolution de la composition du venin des guêpes parasitoïdes Psyttalia (Hymenoptera, Braconidae) et Leptopilina (Hymenoptera, Figitidae) : une cause possible d'échec et de succès en lutte biologique ?

BPI; ESIM

2014NICE4074

23.10.2014

HAN Peng

Effets bottom-up et top-down des variations de fertilisation et d'irrigation sur des réseaux tri-trophiques en agroécosystèmes

CEA

2014NICE4057

23.09.2014

VAYSSADE Chloé

Interaction entre démographie et génétique dans les petites populations : études sur un Hyménoptère parasitoïde avec incompatibilités génétiques

BPI

2014NICE4002

13.02.2014

BERMOND Gérald

Invasion, démographie et évolution : le cas de l'hybridation

BPI

2013NICE4134

16.12.2013

EVANGELISTI Edouard

Analyse fonctionnelle de trois effecteurs RXLR de l'oomycète Phytophthora parasitica sécrétés au cours de la pénétration de la plante hôte

IPO

2013NICE4093

29.11.2013

PIERRE Olivier

Étude du processus de rupture de l'interaction symbiotique medicago truncatula / sinorhizobium meliloti : rôle de cystéine protéases

SYMBIOSE

2013NICE4072

04.10.2013

CHAILLEUX Anaïs

Importance des interactions multi-trophiques dans les agrosystèmes pour la mise au point d'une lutte biologique contre une espèce invasive

CEA

2013NICE4030

13.06.2013

PAGANELLI Laetitia

Étude de partenaires protéiques d’une protéine associée aux microtubules, MAP65-3, indispensable à la formation des cellules géantes induites par le nématode à galles Meloidogyne incognita : caractérisation du complexe de surveillance de la mitose chez Arabidopsis

IPN

2013NICE4028

11.06.2013

RAAD Hussein

Rôle et fonctionnalité des récepteurs gustatifs dans les ailes de drosophiles

GEP

2013NICE4002

25.01.2013

TEIXEIRA ALVES Mickael

Des interactions indirectes entre les proies

M2P2

tel-02808828

25.01.2013

PREVOT Marianne

Étude de la respiration « nitrate-NO » dans l’interaction symbiotique entre Medicago truncatula et Sinorhizobium meliloti

SYMBIOSE

tel-02809747

17.12.2012

SCHMITZ Antonin

Interactions immunité-parasitisme et immunité-symbiose chez les insectes : apport de deux modèles biologiques : drosophile-parasitoïde et puceron-symbiotes-parasitoïde

ESIM

2012NICE4030

03.07.2012

BARON Olga

Caractérisation fonctionnelle des LBP/BPls (Lipopolysaccharide binding proteins/Bactericidal permeability increasing proteins) dans la réponse immunitaire de Biomphalaria glabrata

ID

2012STRAJ016

28.06.2012

VIERA Paolo

Cell cycle maneuvering: A strategy taken by plant parasitic nematodes to induce specialized feeding sites in plant roots

IPN

30.03.2012

BENYAMINA Sofiane

Rôle des rédoxines chez Sinorhizobium meliloti à l’état libre et lors de son interaction symbiotique avec Medicago truncatula.

SYMBIOSE

2012MON20010

29.03.2012

BALDACCI-CRESP Fabien

Étude de l'importance de composés antioxydants lors d'interactions biotrophes pathogènes ou symbiotiques

SYMBIOSE

2011NICE4128

16.12.2011

ANDRIO Emilie

Rôle du peroxyde d'hydrogène dans la symbiose Medicago truncatula et Sinorhizobium melitoli : des systèmes de production aux cibles géniques

SYMBIOSE

15.12.2011

JAOUANNET Maëlle

Caractérisation fonctionnelle d'effecteurs du nématode phytoparasite Meloidogyne incognita participant au succès de l'infection et à la suppression des défenses de l'hôte

IPN

2011NICE4096

01.12.2011