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Ce projet de thèse s’inscrit en partie dans le projet NLRome (voir la fiche projet). La plus grande famille de gènes de résistance aux pathogènes et ravageurs est formée par les gènes de type NLR. Malgré les connaissances accumulées, le rôle spécifique de chaque NLR reste largement méconnu, en particulier dans les résistances quantitatives. Cette méconnaissance est liée à un séquençage/assemblage/annotation qui n’ont pas été satisfaisants avec les technologies short reads du fait de la structure et de l’organisation de ces gènes. L’enjeu scientifique est de décrire pleinement le NLRome d’une espèce, le melon, d’en comprendre le rôle dans l’expression de l’immunité face un large cortège de ravageurs et pathogènes et d’explorer les possibilités de recombinaison dans un cluster de NLR complexe.