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Dernière mise à jour : Mai 2018

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SZADKOWSKI Emmanuel

CR2 Inra - CHARGE DE RECHERCHE

Szadkowski
Equipe REDD

Fonctions - Thématique de Recherche

Généticien de formation, je m’intéresse aux interactions plante - pathogène, et plus particulièrement à la durabilité des résistances aux Oomycètes chez les Solanacées maraichères. Mes compétences reposent sur la biologie moléculaire, la génomique évolutive, la bioinformatique, et évoluent vers la génétique des populations.

Au sein de l’équipe RDS (Résistance Durable chez les Solanacées), j’utilise comme modèles d’étude d’une part la tomate (Solanum lycopersicum) et Phytophthora infestans, et d’autre part le Piment (Capsicum annuum) et P. capsici. Mon objectif est (1) d’identifier les facteurs des pathogènes et des plantes impliqués dans leur interaction; (2) d’analyser leur évolution par des approches d’évolution expérimentale et d’analyse de diversité naturelle, (3) de proposer des associations de différents déterminants génétiques, en collaboration avec des modélisateurs, afin d’améliorer la durabilité des résistances aux Oomycètes.

Formation et Carrière

2016 – CR2 : INRA, UR1052 Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes, équipe RDS, Avignon, France

2016 Postdoctorat : INRA UR1052 Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes, équipe RDS, Avignon, France. « Analyse de diversité de gènes RxLR chez P. infestans et étude de leur rôle dans l’interaction avec la tomate et ses espèces apparentées ».

2011-2013 Postdoctorat : Iowa State University, Ecology, Evolution and Organismal Biology, Wendel Lab, Ames, Iowa, USA. « Etude de la diversité et la conversion génique entre génomes chez le coton polyploïde ».

2007 – 2011 Doctorat : INRA UMR 118 Amélioration des Plantes et Biotechnologies Végétales, équipe Biodiversité et Polyploïdie. « Devenir des génomes et des gènes dans un contexte polyploïde : cas du colza (Brassica napus L.) ».

2007 Master recherche option Génétique, Adaptation et Production Végétale, Agrocampus Rennes – Université de Rennes I. 

Publications sélectionnées

Yoo, M.-J., Szadkowski, E., & Wendel, J. F. (2013). Homoeolog expression bias and expression level dominance in allopolyploid cotton. Heredity, 110(2), 171–180.

Paterson, A. H., Wendel, J. F., Gundlach, H., Guo, H., Jenkins, J., Jin D., Llewellyn, D., Showmaker, K. C., Shu, S., Udall, J., Yoo, M. J., Byers, R., Chen, W., Doron-Faigenboim, A., Duke, M. V., Gong, L., Grimwood, J., Grover, C. E., Grupp, K., Hu, G., Lee, T., Li, J., Lin, L., Liu, T., Marler, B. S., Page, J. T., Roberts, A. W., Romanel, E., Sanders, W. S. , Szadkowski E., … Schmutz, J. (2012). Repeated polyploidization of Gossypium genomes and the evolution of spinnable cotton fibres. Nature, 492(7429), 423–7.

Szadkowski, E., Eber, F., Huteau, V., Lodé, M., Huneau, C., Belcram, H., … Chèvre, A. M. (2010). The first meiosis of resynthesized Brassica napus, a genome blender. New Phytologist, 186(1), 102–112.

Publications/chapitres/posters

ProdINRA

Google Scholar

Liens vers l’ensemble des publications :

Email : emmanuel.szadkowski@inrae.fr