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Dernière mise à jour : Mai 2018

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ROTH Morgane

CR INRAE - CHERCHEUR

Roth
Equipe DADI

Fonctions - Thématique de Recherche

Agronome et généticienne, je cherche à adapter la méthodologie de sélection des arbres fruitiers du genre Prunus (fruits à noyaux) aux conditions de bas intrant par une approche prédictive reposant sur de larges données de phénotypage et de génotypage. Mon travaille porte principalement sur l’abricotier et le pêcher dont j’étudie des panels de ressources génétiques (core-collections) en vergers. Mes objectifs sont de définir les idéotypes résilients chez ces espèces, de caractériser les composantes de la résilience au niveau phénotypique et génomique, et de prédire ces composantes. Ces travaux devraient permettre aux sélectionneurs de répondre plus rapidement à l’urgence climatique et à une demande sociétale forte pour l’abandon des pesticides.

Plus largement, j’ai des compétences en génétique quantitative, en génétique des populations, en bioinformatique et biostatistiques, et je me forme au phénotypage digital.

Formation et Carrière

2020 – présent Chargée de recherche à INRAE – Génétique et amélioration des Prunus

2018-2020         Agroscope Wädenswil, Suisse – Post-Doc sur la génétique d’association et la prédiction génomique chez le pommier

2014-2017         ETH Zurich, Suisse – Thèse en génomique évolutive sur les barrières reproductives entre espèces de tomates sauvages : « Variabilité de la stérilité hybride des graines de tomates sauvages (Solanum sect. Lycopersicon) : signatures phénotypiques et moléculaires dans l’albumen ».

2009-2013         Agrocampus Ouest, Centre de Rennes, France – Diplôme d’ingénieur agronome spécialisé en amélioration des plantes

Publications/chapitres/poster

Roth M, Muranty H, Di Guardo M, Guerra W, Patocchi, A, Costa F (2020) Genomic prediction of fruit texture and training population optimization towards the application of genomic selection in apple. Horticulture Research 7: 148.

 

Roth, M., Florez-Rueda, A. M., & Städler, T. (2019) Differences in effective ploidy drive genome-wide endosperm expression polarization and seed failure in wild tomato hybrids. Genetics 212 : 141-152.

 

Omrani M, Roth M, Roch G, Blanc A, Morris CE,  Audergon JM (2019) Genome-wide association multi-locus and multi-variate linear mixed models reveal two linked loci with major effects on partial resistance of apricot to bacterial canker. BMC Plant Biology 19: 31.

 

Roth M, Florez-Rueda AM, Griesser S, Paris M, Städler T (2018) Incidence and developmental timing of endosperm failure in post-zygotic isolation between wild tomato lineages. Annals of Botany 121 :107-118.

 

Roth M, Florez‐Rueda AM, Paris M, Städler T (2018) Wild tomato endosperm transcriptomes reveal common roles of genomic imprinting in both nuclear and cellular endosperm. The Plant Journal 95: 1084-1101.

Email : morgane.roth@inrae.fr