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Dernière mise à jour : Mai 2018

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EPS TERSYS

Exopolysaccharides in the rhizosphere: A comparative study of extraction methods. Application to their quantification in Mediterranean agricultural soils

Titre du projet : Extraire et analyser les Exopolysaccharides des sols rhizosphériques pour contribuer à répondre aux questions d’adaptation du système sol-plante-fruit en contexte local agronomique d’irrigation économe de la filière de tomates d’industries

Participants scientifiques : C. Doussan, A. Bérard, S. Le Gall

Financement : Fédération de Recherche TERSYS

Période : début du projet 2019

Résumé du projet et de ses objectifs 

Projet porté par l’équipe SWIFT en collaboration avec l’UMR SQPOV.

Les exopolysaccharides (EPS) produits par les racines et transformés pas les microorganismes présents dans la rhizosphère (zone de sol influencée par les racines des plantes) ont probablement un rôle sur les propriétés physiques du sol (sa rétention en eau et son agrégation), et d’interactions avec le fonctionnement des plantes. C’est un axe de recherche que nous investiguons pour contribuer à répondre aux questions agronomiques d’adaptation du système sol-plante-fruit en contexte de limitation en eau (stress hydrique). Un verrou actuel concerne l’extraction, la quantification et la caractérisation de la nature de ces EPS présents dans les sols.

Le projet vise à :

1- Adapter au sol une méthode d’extraction des EPS optimale selon : (i) rendement, (ii) faible contamination par l’extractant et intracelluaire, (iii) adaptée à l’analyse de nombreux échantillons et (iv) facilitant des analyses chimiques ultérieures variées. Il s’agit de comparer sur des sols méditerranéens contrastés, trois techniques d’extraction (CER, EDTA, NaOH+Formaldhyde).

2- Développer un panel de caractérisations chimiques des EPS extraits des sols. En particulier la spectroscopie moyen infra-rouge (MIRS) semble une méthode alternative, simple, rapide et applicable à de nombreux échantillons pour caractériser les EPS extraits des sols et leur diversité.

3- Appliquer la méthode d’extraction optimale mise au point en partie-1 sur une série d’échantillons de sol provenant d’une expérimentation en champ pour étudier des échantillons rhizosphériques à différentes périodes de la phénologie des plantes et selon différents cultivars.

Schéma présentant le contexte et design du projet EPS-TERSYS

Schéma contexte et design du projet EPS-TERSYS