En savoir plus

Email : andrea.modica(at)inrae.fr

Tél. : +33 (0)4 32 72 29 98

INRAE

URFM - UR629

Site Agroparc

Domaine St Paul

F - 84914 AVIGNON Cedex 9

Doctorant à l'Unité de Recherches Écologie des Forêts Méditerranéennes rattachée au Département  Écologie et biodiversité des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques (ECODIV).

Andrea Modica est doctorant (Ecole Doctorale Aix-Marseille Université) dans l'axe disciplinaire BioPopEvol (group GEN). Son sujet de thèse porte sur la génomique du hêtre européen (Fagus sylvatica L.) et s'intitule «Bases génétiques de l'adaptation micro-géographique chez le hêtre commun (Fagus sylvatica L.) et modélisation de ses réponses évolutives aux gradients environnementaux et au changement climatique».

Le projet s'articule autour de trois axes :

1. estimer la divergence génétique entre des sous-populations de hêtres disposées le long d'un gradient altitudinal (site : Mont Ventoux, FR) ;

2. réaliser des analyses Génotype x Phénotype (GPA) sur un jeu de données de reséquençage du génome afin d'identifier la base génétique de différents traits adaptatifs (sites : Mont Ventoux, FR ; La Massane, FR ; Pradaccio ; IT) ;

3. utiliser les loci identifiés au point (2) pour aider à modéliser les processus adaptatifs sur les gradients environnementaux (site : Mont Ventoux, FR).

BIBLIOGRAPHIE

Audigeos D, Brousseau L, Traissac S, Scotti-Saintagne C, Scotti I (2013). Molecular divergence in tropical tree populations occupying environmental mosaics. J Evol Biol 26: 529–544.

Cubry P, Oddou‐Muratorio S, Scotti I, Lefèvre F (2022). Interactions between microenvironment, selection and genetic architecture drive multiscale adaptation in a simulation experiment. J Evol Biol: 1–16.

Gauzere J, Klein EK, Brendel O, Davi H, Oddou-Muratorio S (2020). Microgeographic adaptation and the effect of pollen flow on the adaptive potential of a temperate tree species. New Phytol227: 641–653.

Mishra B, Ulaszewski B, Meger J, Aury J-M, Bodénès C, Lesur-Kupin I, et al. (2022). A Chromosome-Level Genome Assembly of the European Beech (Fagus sylvatica) Reveals Anomalies for Organelle DNA Integration, Repeat Content and Distribution of SNPs. Front Genet 12.

Richardson JL, Urban MC, Bolnick DI, Skelly DK (2014). Microgeographic adaptation and the spatial scale of evolution. Trends Ecol Evol 29: 165–176.

Santure AW, Garant D (2018). Wild GWAS—association mapping in natural populations. Mol Ecol Resour 18: 729–738.

Scotti I, Lalagüe H, Saintagne CS-, Ruiz R, Delphine D, Lefevre F, Cubry P, Fady B, González-Martínez S C, Roig, A, Lesur-Kupin I, Bagnoli, F, Guerin V, Ploimon C, Rozenberg P, Vendramin G G (2022). Common microgeographical selection patterns revealed in four European conifers. Mol Ecol 00: 1–19.

Yeaman S (2022). Evolution of polygenic traits under global vs local adaptation. Genetics 220: iyab134.